#NEXUS 

BEGIN DATA;
DIMENSIONS  NTAX=26 NCHAR=1222;
FORMAT MISSING=? GAP=-  INTERLEAVE  DATATYPE=DNA ;
OPTIONS  MSTAXA=UNCERTAIN ;

MATRIX

[                                      10        20        30        40        50]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   AGGTCCAGCCTGCCCAGTGATAAC-ATGTAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
19Mt.cowani                   AGGTCTGTCCTGCCCAGTGATAAC-?TGTAACGGCCGCGGTACCCTWWCC   [49]
42Mt.nigricans                ???????????GCCCAGTGAT??C-STGTAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
84Mt.haraldmeieri             AGGTCCAGCCTGCCCAGTGATAAC-ATTTAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
68Mt.bernhardi                AGGTCCAGCCTGCCCAGTGACAAC-ATTTAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
01Mt.laevigata                AGGTCCAGCCTGCCCAGTGATAAT-ATTTAACGGCCGCGGTACTCTAACC   [49]
73Mt.laevigata                AGGTCCAGCCTGCCCAGTGATAAT-ATTTAACGGCCGCGGTACTCTAACC   [49]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         AGGTCCAGCCTGCCCAGTGATAATTATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [50]
02Mt.betsileo_Kirindy         AGGTCCAGCCTGCCCAGTGATAAT-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    RRGTCTAGCCTGCCCAGTGATAAT-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
21Mt.betsileo_Anove_a         AGGTCCAGCCTGCCCAGTGATAAT-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
63Mt.viridis                  AGGTCCAGCCTGCCCAGTGATAAT-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
05Mt.viridis                  AGGTCCAGCCTGCCCAGTGATAAT-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
06Mt.expectata                AGGTCCAGCCTGCCCAGTGATAGT-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
69Mt.expectata                AGGTCCAGCCTGCCCAGTGATAGT-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
74Mt.madagascariensis         ????????CCTGCCCAGTGATAAA-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
13Mt.madagascariensis         ????????CCTGCCCAGTGATAAA-ATTCAACGGMCGCGGTACCCTAACC   [49]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    AGGTCTAGCCTGCCCAGTGATAAA-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
17Mt.aurantiaca               AGGTCTAGCCTGCCCAGTGATAAA-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
61Mt.crocea                   AGGTCTAGCCTGCCCAGTGATAAA-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
64Mt.milotympanum             AGGTCTAGCCTGCCCAGTGATAAA-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
67Mt.pulchra                  AGGTCTAGCCTGCCCAGTGATAAA-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
20Mt.pulchra                  AGGTCTAGCCTGCCCAGTGATAAA-ATTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
41Md.bicalcaratus             ????????????????????????-????????GCCGCGGTACCCTAACC   [49]
08Md.grandisonae              AGGTCCAGCCTGCCCAGTGACAAG-GTTCAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]
35Boophis_tephraeomystax      ???????????GCCCGGTGACATA-GTTTAACGGCCGCGGTACCCTAACC   [49]

[                                      60        70        80        90        100]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAT   [99]
19Mt.cowani                   GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAT   [99]
42Mt.nigricans                GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAT   [99]
84Mt.haraldmeieri             GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAT   [99]
68Mt.bernhardi                GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAT   [99]
01Mt.laevigata                GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACCTGTATCAAT   [99]
73Mt.laevigata                GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACCTGTATCAAT   [99]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [100]
02Mt.betsileo_Kirindy         GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAT   [99]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAT   [99]
21Mt.betsileo_Anove_a         GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
63Mt.viridis                  GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
05Mt.viridis                  GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
06Mt.expectata                GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
69Mt.expectata                GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
74Mt.madagascariensis         GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
13Mt.madagascariensis         GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
17Mt.aurantiaca               GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
61Mt.crocea                   GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
64Mt.milotympanum             GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
67Mt.pulchra                  GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
20Mt.pulchra                  GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
41Md.bicalcaratus             GTGCAAAGGTAVMA??ATCACTTGTTCTTTAAATAAGGACTTGTWTCAAC   [99]
08Md.grandisonae              GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGAGGACTTGTATCAAC   [99]
35Boophis_tephraeomystax      GTGCGAAGGTAGCATAATCACTTGTTCTTTAAATGGGGACTCGTATCAAC   [99]

[                                      110       120       130       140       150]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   GGCATCACGAGGGTTTCACTGTCTCCTTTTTCTAATCAGTGAAACTGATC   [149]
19Mt.cowani                   GGCATCACGAGGGTTTCACTGTCTCCTTTTTCTAATCAGTGAAACTGATC   [149]
42Mt.nigricans                GGCATCACGAGGGTTTCACTGTCTCCTTTTTCTAATCAGTGAAACTGATC   [149]
84Mt.haraldmeieri             GGCATCACGAGGGTTTCACTGTCTCCTTTTTCTAATCAGTGAAACTGATC   [149]
68Mt.bernhardi                GGCATCACGAAGGTTATACTGTCTCCTTTCTCTAATCAGTGAAACTGATC   [149]
01Mt.laevigata                GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
73Mt.laevigata                GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [150]
02Mt.betsileo_Kirindy         GGCATCACGAGGGTTATACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    GGCATCACGAGGGTTATACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
21Mt.betsileo_Anove_a         GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
63Mt.viridis                  GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
05Mt.viridis                  GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
06Mt.expectata                GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
69Mt.expectata                GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAATGAAACTGATC   [149]
74Mt.madagascariensis         GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
13Mt.madagascariensis         GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
17Mt.aurantiaca               GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
61Mt.crocea                   GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
64Mt.milotympanum             GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
67Mt.pulchra                  GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
20Mt.pulchra                  GGCATCACGAGGGTTACACTGTCTCCTTTTTCCAATCAGTGAAACTGATC   [149]
41Md.bicalcaratus             GGCATCACGAGGGTTAAACTGTCTCCTTTTTCACATCAGTGAAACTAATC   [149]
08Md.grandisonae              GGCATCACGAGGGTTTAACTGTCTCCTTTCTCCAATCAATGAAACTGATC   [149]
35Boophis_tephraeomystax      GGCATCACGAGGATCACACTGTCTCCCGCCCCTAATCAGTGAAACTGATC   [149]

[                                      160       170       180       190       200]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
19Mt.cowani                   TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTCTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
42Mt.nigricans                TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
84Mt.haraldmeieri             TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
68Mt.bernhardi                TCTCCGTGAAGAAGCGGGGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
01Mt.laevigata                TCCCCGTGAAGAAGCGGGGATTATTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
73Mt.laevigata                TCCCCGTGAAGAAGCGGGGATTATTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         TTCCCGTGAAGAAGCGGGAATTTTTCTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [200]
02Mt.betsileo_Kirindy         TTTCCGTGAAGAAGCGGAAATTTTTCTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    TTTCCGTGAAGAAGCGGAAATTTTTCTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
21Mt.betsileo_Anove_a         TTTCCGTGAAGAAGCGGAAATTTTTCTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
63Mt.viridis                  TTTCCGTGAAGAAGCGGAAATTTTCCTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
05Mt.viridis                  TTTCCGTGAAGAAGCGGAAATTTTTCTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
06Mt.expectata                TTTCCGTGAAGAAGCGGAAATTTTTCTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
69Mt.expectata                TTTCCGTGAAGAAGCGGAAATTTTTCTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
74Mt.madagascariensis         TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
13Mt.madagascariensis         TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
17Mt.aurantiaca               TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
61Mt.crocea                   TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
64Mt.milotympanum             TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
67Mt.pulchra                  TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
20Mt.pulchra                  TCTCCGTGAAGAAGCGGAGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
41Md.bicalcaratus             TCCCCGTGAAGAAGCGGGAATAGTTCTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
08Md.grandisonae              TTCCCGTGAAGAAGCGGGGATTTCCTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]
35Boophis_tephraeomystax      TCCCCGTGAAGAAGCGGGGATTTTTTTATAAGACGAGAAGACCCCATGGA   [199]

[                                      210       220       230       240       250]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   GCTTTAAACCCAATTACACTCCTAT-TTTTTATTAACCT-CTTAGACTAT   [247]
19Mt.cowani                   GCTTTAAACCCAATTACACTCCTAT-TT-TTATTAACCT-CTTAGACTAT   [246]
42Mt.nigricans                GCTTTAAACCCAATTACACTCCTAT-TTTTTATTAACCT-CTTAGACTAT   [247]
84Mt.haraldmeieri             GCTTTAAACCCAATTGCACTCCTAT-TTTTTATTAACCT-CTTAGACTAC   [247]
68Mt.bernhardi                GCTTTAAACCCAATTGTACTCCTAT-TTTTTATAA-CCT-CTTAAACCAT   [246]
01Mt.laevigata                GCTTTAAACCCAGCTGCACTCCTATCTTTCTAATA-CCA-CTTAAATCAC   [247]
73Mt.laevigata                GCTTTAAACCCAGCTGCACTCCTATCTTTCTAATA-CCA-CTTAAATCAC   [247]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         GCTTAAAACCCAAGTGCACTCCTAT-TAACTACTA-CCG-CTTAAATTAT   [247]
02Mt.betsileo_Kirindy         GCTTAAAACCCAAGTGCACTCCTAT-TAACTACTT-CCA-CTTAAATTAT   [246]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    GCTTAAAACCCAAGTGCACTCCTAT-TAACTACTT-CCA-CTTAAATTAT   [246]
21Mt.betsileo_Anove_a         GCTTAAAACCCAAGTGCACTCCTAT-TAACTACTA-CCG-CTTAAATTAT   [246]
63Mt.viridis                  GCTTAAAACCCAAGTGCACTCCTAT-TAACTACTA-CCG-CTTAAATTAT   [246]
05Mt.viridis                  GCTTAAAACCCAAGTGCACTCCTAT-TAACTACTA-CCG-CTTAAATTAT   [246]
06Mt.expectata                GCTTAAAACCCAAGTGCACTCCTAT-TAACCACTA-CCG-CTTAAATTAT   [246]
69Mt.expectata                GCTTAAAACCCAAGTGCACTCCTAT-TAACCACTA-CCG-CTTAAATTAT   [246]
74Mt.madagascariensis         GCTTTAAACCCACCTGCACTCCTAT-TTTCTATTG-CCT-CTAAAACTAT   [246]
13Mt.madagascariensis         GCTTTAAACCCACCTGCACTCCTAT-TTTCTACTG-CCT-CTAAAACTAT   [246]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    GCTTTAAACCCACCTGCACTCCTAT-TTTCTATTA-CCT-CTAAAACTAT   [246]
17Mt.aurantiaca               GCTTTAAACCCACCTGCACTCCTAT-TTTCTATTA-CCT-CTAAAACTAT   [246]
61Mt.crocea                   GCTTTAAACCCACCTGCACTCCTAT-TTTCTATTA-CCT-CTAAAACTAT   [246]
64Mt.milotympanum             GCTTTAAACCCACCTGCACTCCTAT-TTTCTATTA-CCT-CTAAAACTAT   [246]
67Mt.pulchra                  GCTTTAAACCCACCTGCACTCCTAT-TTTCTACTA-CCT-CTAAAACTAT   [246]
20Mt.pulchra                  GCTTTAAACCCACCTGCACTCCTAT-TTTCTACTA-CCT-CTAAAACTAT   [246]
41Md.bicalcaratus             GCTTTAAACCCAACTACACCCCCAT-TAATC-CCA-CC--TTTAAACATT   [244]
08Md.grandisonae              GCTTTAAACCCAGCTACACCTCTAT-TTT-TATTC-CAC-TTTAACCTTT   [245]
35Boophis_tephraeomystax      GCTTTAAACCCGATGACACCCCCGC-CCTATTTAGACCTACGCATTCGTT   [248]

[                                      260       270       280       290       300]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   GGATATTTGTATATTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCACGGAGCATAACT   [296]
19Mt.cowani                   GGATGTTTGTATATTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCACGGAGCATAACT   [295]
42Mt.nigricans                GGATATTTGTATATTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCACGGAGCATAACT   [296]
84Mt.haraldmeieri             GGATATTTGTATATTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCACGGAGCATAATT   [296]
68Mt.bernhardi                GGAATCT-ACACACTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCACGGAGCTTAATT   [294]
01Mt.laevigata                GGACCCT-GCACACTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCATAATC   [295]
73Mt.laevigata                GGACCCT-GCACACTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCATAATC   [295]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         GGATTTTTGTATACTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCATAACC   [296]
02Mt.betsileo_Kirindy         GGATTTTTGTATACTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCATAACT   [295]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    GGATTTTTGTATACTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCATAACC   [295]
21Mt.betsileo_Anove_a         GGATTTTTGTATACTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCATAACC   [295]
63Mt.viridis                  GGATTTTTGTATACTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCATAACC   [295]
05Mt.viridis                  GGATTTTTGTATACTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCATAACC   [295]
06Mt.expectata                GGATTCTTGTATACTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCATAACC   [295]
69Mt.expectata                GGATTCTTGTATACTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCATAACC   [295]
74Mt.madagascariensis         GGAATCT-GCATTCTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCACAATA   [294]
13Mt.madagascariensis         GGAATCT-GCATTCTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCACAATA   [294]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    GGAATCT-GCATTCTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCACAATA   [294]
17Mt.aurantiaca               GGAATCT-GCATTCTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCACAATA   [294]
61Mt.crocea                   GGAATCT-GCATTCTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCACAATA   [294]
64Mt.milotympanum             GGAATCT-GCATTCTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCACAATA   [294]
67Mt.pulchra                  GGAATCT-GCATTCTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCACAATA   [294]
20Mt.pulchra                  GGAATCT-GCATTCTT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCACAATA   [294]
41Md.bicalcaratus             GGGGCCCTGTATGTTTTGGTTTTGGGTTGGGGTGACCACGGAGCACAAAC   [294]
08Md.grandisonae              AGAACCCTGTATGCCT-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGCATAAAT   [294]
35Boophis_tephraeomystax      GGGGACCTGTTCACTC-GGTTTTAGGTTGGGGTGACCGCGGAGTAAAACA   [297]

[                                      310       320       330       340       350]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   TAGCCTCCATGATGAACGGGATTTTACCCCTTATCCAAGAACTACACCTC   [346]
19Mt.cowani                   TAGCCTCCATGATGAACGGGATTTTACCCCTTATCCAAGAACTACACCTC   [345]
42Mt.nigricans                TAGCCTCCATGATGAACGGGATTTTACCCCTTATCCAAGAACTACACCTC   [346]
84Mt.haraldmeieri             TAGCCTCCATGATGAACGGGATTTTACCCCTTATCCAAGAACTACACCTC   [346]
68Mt.bernhardi                TAGCCTCCATGATGAACGGGACTAT-CCCCTTATCTAAGAGCAACATCTC   [343]
01Mt.laevigata                TAGCCTCCACGATGAACGGGACTAC-CCCCTTATCTAAGAGCCACACCTC   [344]
73Mt.laevigata                TAGCCTCCACGATGAACGGGACTAC-CCCCTTATCTAAGAGCCACACCTC   [344]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         TAGCCTCCACGATGAACAGGACTAC-CTCCTCATCTAAGAGCCACACCTC   [345]
02Mt.betsileo_Kirindy         TAGCCTCCACGATGAACAGGACTAC-CTCCTTATCTAAGAGCCACACCTC   [344]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    TAGCCTCCACGATGAATAGGACTAC-CTCCTTATCTAAGAGCCACACCTC   [344]
21Mt.betsileo_Anove_a         TAGCCTCCACGATGAACAGGACTAC-CTCCTCATCTAAGAACCACACCTC   [344]
63Mt.viridis                  TAGCCTCCACGATGAACAGGATTAC-CTCCTCATCTAAGAGCCACACCTC   [344]
05Mt.viridis                  TAGCCTCCACGATGAACAGGATTACCTCC-TCATCTAAGAGCCACACCTC   [344]
06Mt.expectata                TAGCCTCCACGATGAACAGGACTAC-CTCCTTATCTAAGAGCTACACCTC   [344]
69Mt.expectata                TAGCCTCCACGATGAACAGGACTAC-CTCCTTATCTAAGAGCTACACCTC   [344]
74Mt.madagascariensis         CAGCCTCCACGATGAACGGGATTACCCCC-TTATCTAAGAGCTACACCTC   [343]
13Mt.madagascariensis         CAGCCTCCACGATGAACGGGGTTTACCCCCTTATCTAAGAGCTACACCTC   [344]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    CAGCCTCCACGATGAACGGGATTACCCCCCTTATCTAAGAGCTACACCTC   [344]
17Mt.aurantiaca               CAGCCTCCACGATGAACGGGA-TTACCCCCTTATCTAAGAGCTACACCTC   [343]
61Mt.crocea                   TAGCCTCCACGATGAACGGGATTAC-CCCCTTATCTACGAGCTACACCTC   [343]
64Mt.milotympanum             TAGCCTCCACGATGAACGGGATTAC-CCCCTTATCTACGAGCTACACCTC   [343]
67Mt.pulchra                  TAGCCTCCACGATGAACGGGATTAT-CCCCTTATCTAAGAGCAACACCTC   [343]
20Mt.pulchra                  TAGCCTCCACGATGAACGGGATTAT-CCCCTTATCTAAGAGCAACACCTC   [343]
41Md.bicalcaratus             TAGCCTCCACAATGAACAAGACTCCTCTCTTTATCTAAGACCCACACCTC   [344]
08Md.grandisonae              TAGCCTCCACGATGAACGGGAATTATTCCCTTACCCAAGAACTACGCCTC   [344]
35Boophis_tephraeomystax      AAACCTCCACGAAGAATGGGCTTAC-CCCCTTATCCAAGAGAGACATCTC   [346]

[                                      360       370       380       390       400]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   TAAGAACTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGATAATC--GATCAACGAA   [394]
19Mt.cowani                   TAAGAACTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGATAATC--GATCAACGAA   [393]
42Mt.nigricans                TAAGAACTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGATAATC--GATCAACGAA   [394]
84Mt.haraldmeieri             TAAGAACTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGATAATC--GATCAACGAA   [394]
68Mt.bernhardi                TAAGAACTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGTCAATC--GATCAACGAA   [391]
01Mt.laevigata                TAAGAACTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [392]
73Mt.laevigata                TAAGAACTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [392]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         TAAGAAATAGTATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [393]
02Mt.betsileo_Kirindy         TAAGAACTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [392]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    TAAGAACTAGCATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [392]
21Mt.betsileo_Anove_a         TAAGAAATAGTATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [392]
63Mt.viridis                  TAAGAAATAGTATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [392]
05Mt.viridis                  TAAGAAATAGTATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [392]
06Mt.expectata                TAAGAACTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [392]
69Mt.expectata                TAAGAACTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [392]
74Mt.madagascariensis         TAAGAATTAGCATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [391]
13Mt.madagascariensis         TAAGAATTAGCATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [392]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    TAAGAATTAGCATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [392]
17Mt.aurantiaca               TAAGAATTAGCATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [391]
61Mt.crocea                   TAAGAATTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [391]
64Mt.milotympanum             TAAGAATTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGACAATC--GATCAACGAA   [391]
67Mt.pulchra                  TAAGAATTAGAATTCTAACATAAAATGATCCGATAATC--GATCAACGAA   [391]
20Mt.pulchra                  TAAGAATTAGAATTCTAACATAAAATGATCCGATAGTC--GATCAACGAA   [391]
41Md.bicalcaratus             CMAGAATTAGCACTCT?ACMTAAAATGATCCGATATTC--GATCMATGAA   [392]
08Md.grandisonae              TAAGAATTAGTATTCTAACATAAAATGATCCGGCTATC-CGATCAACGAA   [393]
35Boophis_tephraeomystax      TAAGAATTAGTAAACTAACATCTAATGATCCGATTTTTTCGATCAACGAA   [396]

[                                      410       420       430       440       450]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCTCCTATCG   [444]
19Mt.cowani                   CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCTCCTATCG   [443]
42Mt.nigricans                CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCTCCTATCG   [444]
84Mt.haraldmeieri             CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCTCCTATCG   [444]
68Mt.bernhardi                CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCTCCTATCG   [441]
01Mt.laevigata                CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCTACTTCAAGAGTCCCTATCG   [442]
73Mt.laevigata                CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCTACTTCAAGAGTCCCTATCG   [442]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         CAAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [443]
02Mt.betsileo_Kirindy         CAAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [442]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    CAAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [442]
21Mt.betsileo_Anove_a         CAAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [442]
63Mt.viridis                  CAAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [442]
05Mt.viridis                  CAAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [442]
06Mt.expectata                CAAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [442]
69Mt.expectata                CAAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [442]
74Mt.madagascariensis         CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [441]
13Mt.madagascariensis         CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [442]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [442]
17Mt.aurantiaca               CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [441]
61Mt.crocea                   CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCTCCTATCG   [441]
64Mt.milotympanum             CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCTCCTATCG   [441]
67Mt.pulchra                  CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [441]
20Mt.pulchra                  CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCCCCTATCG   [441]
41Md.bicalcaratus             CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCMAGAGCCCCTATCG   [442]
08Md.grandisonae              CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCTCCTATCG   [443]
35Boophis_tephraeomystax      CCAAGTTACCCTGGGGATAACAGCGCAATCCACTTCAAGAGCTCATATCG   [446]

[                                      460       470       480       490       500]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [494]
19Mt.cowani                   ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTARTGGTGCA   [493]
42Mt.nigricans                ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [494]
84Mt.haraldmeieri             ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [494]
68Mt.bernhardi                ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [491]
01Mt.laevigata                CCAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [492]
73Mt.laevigata                CCAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTA?TGGTGCA   [492]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         CCAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [493]
02Mt.betsileo_Kirindy         CCAAGTGGGTTTACGACCTCMATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [492]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    CCAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [492]
21Mt.betsileo_Anove_a         CCAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [492]
63Mt.viridis                  CCMAGTKGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [492]
05Mt.viridis                  CCAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [492]
06Mt.expectata                CCAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [492]
69Mt.expectata                CCAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [492]
74Mt.madagascariensis         ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [491]
13Mt.madagascariensis         ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [492]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [492]
17Mt.aurantiaca               ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTARTGGTGCA   [491]
61Mt.crocea                   ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [491]
64Mt.milotympanum             ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [491]
67Mt.pulchra                  ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [491]
20Mt.pulchra                  ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [491]
41Md.bicalcaratus             ACAAGTGGGTTTACGAMCTCVATGTTGGATCAGGGTATCCTAGTGGTGCA   [492]
08Md.grandisonae              ACAAGTGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGGTGTCCTAGTGGTGCA   [493]
35Boophis_tephraeomystax      ACAAGTGGGTTTACGACCTC?ATGTTGGATCAGGGTATCCCAGTGGTGCA   [496]

[                                      510       520       530       540       550]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   GCAATTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [544]
19Mt.cowani                   GCAATTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [543]
42Mt.nigricans                GCAATTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [544]
84Mt.haraldmeieri             GCAATTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [544]
68Mt.bernhardi                GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [541]
01Mt.laevigata                GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [542]
73Mt.laevigata                GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [542]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [543]
02Mt.betsileo_Kirindy         GCAGCTACTAARGGTTCGTTTGTTCAACAATTAAAACCCTACGTGATCTG   [542]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [542]
21Mt.betsileo_Anove_a         GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [542]
63Mt.viridis                  GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGAWTAAAACCCTACGTGATCTG   [542]
05Mt.viridis                  GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [542]
06Mt.expectata                GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [542]
69Mt.expectata                GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [542]
74Mt.madagascariensis         GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [541]
13Mt.madagascariensis         GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [542]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [542]
17Mt.aurantiaca               GCA?CTACTAAAGGTTCGTTTGTTC?ACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [541]
61Mt.crocea                   GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [541]
64Mt.milotympanum             GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [541]
67Mt.pulchra                  GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [541]
20Mt.pulchra                  GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [541]
41Md.bicalcaratus             GCAGCTACTAAAGGTTCGTT-GTTCAACGAWTAAAACCCTACGTGATCTG   [541]
08Md.grandisonae              GCAGCTACTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [543]
35Boophis_tephraeomystax      GCAGCTACTAATGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAACCCTACGTGATCTG   [546]

[                                      560       570       580       590       600]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   AGT??????????????GAGTYCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [594]
19Mt.cowani                   AGT??????????????GAGTYCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [593]
42Mt.nigricans                AGT??GTAAAATTTGCCGAGTTCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [594]
84Mt.haraldmeieri             AGT?????????????CGAGYYCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [594]
68Mt.bernhardi                AGT?????????????CGAGTYCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [591]
01Mt.laevigata                AGT?????????????CGAGTYCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [592]
73Mt.laevigata                AGT??GTAAGATTTGCCGAGTTCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [592]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         AGT??GTAGGATTTGCCGAGTTCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [593]
02Mt.betsileo_Kirindy         AGT???????????????????CCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [592]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    AGT??GTAGGATTTGCCGAGTTCCTTCTTTTTCTTTTAGTCTTTCCATTA   [592]
21Mt.betsileo_Anove_a         AGT??GTAGGATTTGCCGAGTTCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [592]
63Mt.viridis                  AGT???????????????????????????????????ATCTTTCCATTA   [592]
05Mt.viridis                  AGT???????????????????????????????????????????????   [592]
06Mt.expectata                AGT???????????????????????????????????ATCTTTCCATTA   [592]
69Mt.expectata                AGTGGTTAGGATTTGCCGAGTTCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [592]
74Mt.madagascariensis         AGT??????????????????????????????????????????CATTA   [591]
13Mt.madagascariensis         AGT???????????????AGTYCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [592]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    AGT????????????????????CTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [592]
17Mt.aurantiaca               AGT????????????????????????????????????????????TTA   [591]
61Mt.crocea                   AGT????????????????GTTCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [591]
64Mt.milotympanum             AGT??GTAAGATTTGCCGAGTTCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [591]
67Mt.pulchra                  AGT???????????????????????????????????????????????   [591]
20Mt.pulchra                  AGT????????????????TGTCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [591]
41Md.bicalcaratus             AGT??????????????GAGYCCCTTCTTTWTCTTTTGATCTTTCCATAA   [591]
08Md.grandisonae              AGT?????????????CGAGYYCCTTCTTTTTCTTTTAATCTTTCCATTA   [593]
35Boophis_tephraeomystax      AGT?????????????CGAGTYCCTTCCCCCCCTTTTAATCTTTCCATAA   [596]

[                                      610       620       630       640       650]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   ATGTTCTGGTGTAAGGTTAACGTTTTTATTTGTAGGGTTTTCTTGAT--T   [642]
19Mt.cowani                   ATGTTCTAGTGTAAGGTTAACGTTTTTATTTGTAGGGTTTTCTTGAT--T   [641]
42Mt.nigricans                ATGTTCTGGTGTAAGGTTAACGTTTTTATTTGTAGGGTTTTCTTGAT--T   [642]
84Mt.haraldmeieri             ATGTTCTGGTGTAAGGTTAACGTTTTTATTTGTAGGGTTTTCTTGAT--T   [642]
68Mt.bernhardi                ATGTTCTGGTGTAAGATTAACGTTTGAGTTTGTAGTGTTTTCTAGGTAGG   [641]
01Mt.laevigata                ATGTTCTTGTGTAAGGTTAACGTTTTGATTTATAGGGTTTTCTTGGT--G   [640]
73Mt.laevigata                ATGTTCTTGTGTAAGGTTAACGTTTTGATTTATAGGGTTTTCTTGGT--G   [640]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         ATGTTCTTGTGTAAGGTTAACGTTTTGATTTGTAGAGTTTTCTTGGTA-T   [642]
02Mt.betsileo_Kirindy         ATGTTCTTGTGTAAGGTTAACGTTTTGGTTTGTAGAGTTTTCTTGGT--G   [640]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    ATGTTCTTGTGTAAGGTTAACGTTTTGGTTTGTAGAGTTTTCTTGGT--G   [640]
21Mt.betsileo_Anove_a         ATGTTCTTGTGTAAGGTTAACGTTTTGATTTGTAGAGTTTTCTTGGT--A   [640]
63Mt.viridis                  ATGCTCTTGTGTAAGGTTAACGTTTTGATTTGTAGAGTTTTCTTGGT--A   [640]
05Mt.viridis                  ?????CTTGTGTAAGGTTAACGTTTTGATTTGTAGAGTTTTCTTGGT--A   [640]
06Mt.expectata                ATGTTCTTGTGTAAGGTTAACGTTTTGATTTGTAGGGTTTTCTTGGT--G   [640]
69Mt.expectata                ATGTTCTTGTGTAAGGTTAACGTTTTGATTTGTAGGGTTTTCTTGGT--G   [640]
74Mt.madagascariensis         ATGTTCTAGTGTAAGGTTAACGTTTTGGTTTGTAGAATTTTCTTGAT--T   [639]
13Mt.madagascariensis         ATGTTCTAGTGTAAGGTTAACGTTTTGGTTTGTAGAATTTTCTTGGT--T   [640]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    ATGTTCTAGTGTAAGGTTAACGTTTTGGTTTGTAGAATTTTCTTGAT--T   [640]
17Mt.aurantiaca               ATGTTCTAGTGTAAGGTTAACGTTTTGGCTTGTAGAATTTTCTTGAT--T   [639]
61Mt.crocea                   ATGTTCTAGTGTAAGGTTAACGTTTTGGTTTGTAGAATTTTCTTGAT--T   [639]
64Mt.milotympanum             ATGTTCTAGTGTAAGGTTAACGTTTTGGTTTGTAGAATTTTCTTGAT--T   [639]
67Mt.pulchra                  ??GTTCTAGTGTGAGGTTAACGTTTTAGTTTGTAGAGTTTTCTTGAT--T   [639]
20Mt.pulchra                  ATGTTCTAGTGTGAGGTTAACGTTTTAGTTTGTAGAGTTTTCTTGAT--T   [639]
41Md.bicalcaratus             ATGCTCTGGTGTAAGTTTAACGTTAAAATATTTAAGGTTTTCTTGTG--A   [639]
08Md.grandisonae              ATGTTCTAGTGTAAGGTTAACGTTATTATTTTTAGGTTTTTCTTGTAAGG   [643]
35Boophis_tephraeomystax      ATGCTCTAGTGTAAGGTTAACGCTAAAAATTTTAGGGTTTTCTTGAA--G   [644]

[                                      660       670       680       690       700]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   GGTTGCTAAATGGGGTTCAATTTCGTTAATTGCCATTAGTTTGTCAGATG   [692]
19Mt.cowani                   GGTTGCTAAAGGGGGTTCAATATCGTTAATTGCCATTAGTTTGTCAGATG   [691]
42Mt.nigricans                GGTTGCTAAATGGGGTTCAATTTCGTTAATTGCCATTAGTTTGTCAGATG   [692]
84Mt.haraldmeieri             GGTTGCTAAATGGGGTTCAACTTCGTTAATTGCCATTAGTTTGTCAGATG   [692]
68Mt.bernhardi                GGTTGTTAAAGTTGGCTCATTTACGTTAATTGCCATTAGTTTGTCTAATG   [691]
01Mt.laevigata                GGTTGCTAAAGTAGGTTCAGCTTCGTTAATTGCCAGTTGTTTATCGGATA   [690]
73Mt.laevigata                GGTTGCTAAAGTAGGTTCAGCTTCGTTAATTGCCAGTTGTTTATCGGATA   [690]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         AGTTACTAAAGGGGGCTCAATTTCGTTAATTGCCATTGGTTTGTCTAATA   [692]
02Mt.betsileo_Kirindy         TGTTACTAAAGGGGGCTCAATTTCGTTAATTGCCATTAGTTGGTCTAATA   [690]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    TGTTACTAAAGGGGGCTCAATTTCGTTAATTGCCATTAGTTGGTCTAATA   [690]
21Mt.betsileo_Anove_a         TGTTACTAAAGGGGGCTCAATTTCGTTAATTGCCATTGGTTTGTCTAATA   [690]
63Mt.viridis                  TGTTACTAAAGGGGGCTCAATTTCGTTAATTGCCATTGGTTTGTCTAATA   [690]
05Mt.viridis                  TGTTACTAAAGGGGGCTCAATTTCGTTAATTGCCATTGGTTTGTCTAATA   [690]
06Mt.expectata                TGTTGCTAAAGGGGGCTCAATTTCGTTAATTGCCATTGGTTAGTCCAATA   [690]
69Mt.expectata                TGTTGCTAAAGGGGGCTCAATTTCGTTAATTGCCATTGGTTAGTCCAATA   [690]
74Mt.madagascariensis         AGTTACTAAAGGAGGTTCATTTTCGTTAATTGCCATTAGTTTATCTGATG   [689]
13Mt.madagascariensis         AGTTACTAAAGGAGGTTCATTTTCGTTAATTGCCATTAGTTTATCTAATG   [690]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    AGTTACTAAAGGGGGTTCATTTTCGTTAATTGCCATTAGTTTATCTAATG   [690]
17Mt.aurantiaca               AGTTACTAAAGGGGGTTCATTTTCGTTAATTGCCATTAGTTTATCTAATG   [689]
61Mt.crocea                   AGTTACTAAAGGAGGTTCATTTTCGTTAATTGCCATTAGCTTATCTAATG   [689]
64Mt.milotympanum             AGTTACTAAAGGAGGTTCATTTTCGTTAATTGCCATTAGTTTATCTAATG   [689]
67Mt.pulchra                  AGTTACTAAAGGGGGTTCATTTTCGTTAATTGCCATTAGTTTATCTAATG   [689]
20Mt.pulchra                  AGTTACTAAAGGGGGTTCATTTTCGTTAATTGCCATTAGTTTATCTAATG   [689]
41Md.bicalcaratus             GGTTAATAAAGTGGACTCATAAACGTTAAATGCCAATAGTTTGTCTAAAG   [689]
08Md.grandisonae              TGTTACTAAAGTTAATTCATTTTCGTTAATCGCCAATAGT--GTCTAAAA   [691]
35Boophis_tephraeomystax      CGTTGCTAAATGAGGCTCATTTGCGTTAATTGCCAGTAGATAGTCTATTG   [694]

[                                      710       720       730       740       750]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   TGGCTTAGACTTACATTTT-GGAGAAAAA-CTATTTCTTGTTACTAGTTC   [740]
19Mt.cowani                   TGGCTTAGACTTACATTTT-GGAGAAAAA-CTATTTCTTGTTACTAGTTC   [739]
42Mt.nigricans                TGGCTTAGACTTACATTTT-GGAGAAAAA-CTATTTCTTGTTACTAGTTC   [740]
84Mt.haraldmeieri             TGGCTTAGACTTACATTTT-GGAGAAAAA-CTATTTCTTGTTACTAGTTC   [740]
68Mt.bernhardi                TGGCTTAGGCTTACATTTT-GGAGAAAGT-CTATTTCTTGTTACTAGTTC   [739]
01Mt.laevigata                TGGCTTAAGTTTACATTTT-GGAGAAAGG-TTGTTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
73Mt.laevigata                TGGCTTAAGTTTACATTTT-GGAGAAAGG-TTGTTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         TGGCTTAAGTTTACATTTT-GGAGAAAAA-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [740]
02Mt.betsileo_Kirindy         TGGCTTAAGTTTACATTTT-GGAGAAAAA-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    TGGCTTAAGTTTACATTTT-GGAGAAAAA-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
21Mt.betsileo_Anove_a         TGGCTTAAGTTTACATTTT-GGAGAAAAA-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
63Mt.viridis                  TGGCTTAAGTTTACATTTT-GGAGAAAAA-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
05Mt.viridis                  TGGCTTAAGTTTACATTTT-GGAGAAAAA-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
06Mt.expectata                TGGCTTAAGTTTACATTTT-GGAGAAAAA-CTATTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
69Mt.expectata                TGGCTTAAGTTTACATTTT-GGAGAAAAA-CTATTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
74Mt.madagascariensis         TGGCTTAGACTTACATTTT-GGAGAAAAG-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [737]
13Mt.madagascariensis         TGGCTTAGACTTACATTTT-GGAGAAAGG-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    TGGCTTAGACTTACATTTT-GGAGAAAAG-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
17Mt.aurantiaca               TGGCTTAGACTTACATTTT-GGAGAAAAG-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [737]
61Mt.crocea                   TGGCTTAGACTTACATTTT-GGAGAAAAG-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [737]
64Mt.milotympanum             TGGCTTAGACTTGCATTTT-GGAGAAAAG-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [737]
67Mt.pulchra                  TGGCTTAGACTTACATTTT-GGAGAAAAG-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [737]
20Mt.pulchra                  TGGCTTAGACTTACATTTT-GGAGAAAAG-TTATTTCTTGTTACTAGTTC   [737]
41Md.bicalcaratus             TGGCTTAAGCCTACATTTTTGGAGAAGTT-CTGCTTCTTGTTACTAGTTC   [738]
08Md.grandisonae              TGGCTTAGGCTTACATTTT-GGAGAAGTT-CTACTTCTTATTACTAGTTC   [739]
35Boophis_tephraeomystax      TGGCTTAAACTTACATTTT-GGAGAAAAATCTTTTTCTTGTTACTAGTTC   [743]

[                                      760       770       780       790       800]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   TAGCATTATATTTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGTTAAAGG   [790]
19Mt.cowani                   TAGCATTATATTTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGTTAAAGG   [789]
42Mt.nigricans                TAGCATTATATTTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGTTAAAGG   [790]
84Mt.haraldmeieri             TAGCATTATATTTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGTTAAAGG   [790]
68Mt.bernhardi                TAGCATAATATTTTTCATATTTTTATGAAATTACTCAATACTGTGGAAGG   [789]
01Mt.laevigata                TAGCATAATATCTTTCATATTTTTATGAAATTACTCAATATTGGGGAAGG   [788]
73Mt.laevigata                TAGCATAATATCTTTCATATTTTTATGAAATTACTCAATATTGGGGAAGG   [788]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         TAGCATTATATTTTTCATATTTTTATGAAATTACTCAATATTGGAGAAGG   [790]
02Mt.betsileo_Kirindy         TAGCATTATATTTTTCATATTTTTATGAAATTACTCAATATTGGAGAAGG   [788]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    TAGCATTATATTTTTCATATTTTTATGAAATTACTCAATATTGGAGAAGG   [788]
21Mt.betsileo_Anove_a         TAGCATTATACTTTTCATATTTTTATGAAATTACTCAATATTGGAGAAGG   [788]
63Mt.viridis                  TAGCATTATATTTTTCATATTTTTATGAAATTACTCAATATTGGAGAAGG   [788]
05Mt.viridis                  TAGCATTATATTTTTCATATTTTTATGAAATTACTCAATATTGGAGAAGG   [788]
06Mt.expectata                TAGCATTATATCTTTCATATTTTTATGAAATTACTCAATATTGGAGAAGG   [788]
69Mt.expectata                TAGCATTATATCTTTCATATTTTTATGAAATTACTCAATATTGGAGAAGG   [788]
74Mt.madagascariensis         TAGCATAATATCTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGGGGAGGG   [787]
13Mt.madagascariensis         TAGCATAATATCTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGGGGAGGG   [788]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    TAGCATAATATCTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGGGGAGGG   [788]
17Mt.aurantiaca               TAGCATAATATCTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGGGGAGGG   [787]
61Mt.crocea                   TAGCATAATATCTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGGGGATGG   [787]
64Mt.milotympanum             TAGCATAATATCTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGGGGATGG   [787]
67Mt.pulchra                  TAGCATAATATCTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGGAGAGGG   [787]
20Mt.pulchra                  TAGCATAATATCTTCCATATTTTTATGGAATTACTCAATATTGGGGAGGG   [787]
41Md.bicalcaratus             TAGCATTATATCTTCCATATTCTTATGGAGTTACTCAATATTAATAATGG   [788]
08Md.grandisonae              TAGCATAAAATCTTCCATAGGGTTATGGAATTACTCAATACTAATTATGG   [789]
35Boophis_tephraeomystax      TAGCATAATAGCTTCCATAGGGTTATGGAGTTACTTAATAATGGTGAAGG   [793]

[                                      810       820       830       840       850]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   GTTTTAAAT-AATGTAGGAAATTTAAGAAAG--AAAATGTTAAGCTTTAA   [837]
19Mt.cowani                   GTTTTAAAT-AGTGTATGAAATTAAAGAAAG--AAAATGTTAAGCTTTAA   [836]
42Mt.nigricans                GTTTAAAAT-AATGTAGGAAATTTAAGAAAT--AAAATGTTAAGCTTTAA   [837]
84Mt.haraldmeieri             GTTTTAAAT-AATGTAGGAAATTAAAGAAAG--AAAATGTTAAGCTTTAA   [837]
68Mt.bernhardi                GTTTTAAAT-AGTGTAAGGAATTAGAAAAAG--AAAGTACTAAGCTTTAA   [836]
01Mt.laevigata                GTTTTAAGT-GGTGCGGGGGATTATAAAAAG--GAAATGTAAAGCTTTAA   [835]
73Mt.laevigata                GTTTTAAGT-GGTGCGGGGGATTATAAAAAG--GAAATGTAAAGCTTTAA   [835]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         GTTTTAAAT-GGTATGGGGGATTAGGAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTAA   [837]
02Mt.betsileo_Kirindy         GTTTTAAAT-AGTGTAGGGGATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTAA   [835]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    GTTTTAAAT-AGTGTAGGGGATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTAA   [835]
21Mt.betsileo_Anove_a         GTTTTAAAT-GGTATGGGGGATTAGGAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTAA   [835]
63Mt.viridis                  GTTTTAAAT-GGTATGGGGGATTAGGAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTAA   [835]
05Mt.viridis                  GTTTTAAGT-GGTATGGGGGATTGGGAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTAA   [835]
06Mt.expectata                GTTTTAAAT-AGTGTAAGGGATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTAA   [835]
69Mt.expectata                GTTTTAAAT-AGTGTAAGGGATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTAA   [835]
74Mt.madagascariensis         GTTTTAGGT-GGTTTGAGGAATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTGA   [834]
13Mt.madagascariensis         GTTTTAGGT-GGTTTGAGGAATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTGA   [835]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    GTTTTAGGT-GGTTTGAGGAATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTGA   [835]
17Mt.aurantiaca               GTTTTAGGT-GGTTTGAGGAATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTGA   [834]
61Mt.crocea                   GTTTTAGGT-GGTTTGAGGAATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTGA   [834]
64Mt.milotympanum             GTTTTAGGT-GGTTTGAGGAATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTGA   [834]
67Mt.pulchra                  GTTTTAGAT-GGTTTGAGGAATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTGA   [834]
20Mt.pulchra                  GTTTTAGAT-GGTTTGAGGAATTAGAAAAAG--AAAATGTTAAGCTTTGA   [834]
41Md.bicalcaratus             GTTGTATGTTAATAAGGTTATTTTATAAGAA--TAAAAGTAAAGCTTTAA   [836]
08Md.grandisonae              GTTGAATAA-TAATAAAGGCATTAAATGGAA--AAAATAGTAAACTTTAA   [836]
35Boophis_tephraeomystax      GTTAAAGAA-GAATTGAGGTATTGAGGAGACTTATAGTGCTAAGCTTTGA   [842]

[                                      860       870       880       890       900]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   CGCTTTTATTTAAGGTGGCTGCTTTTAGGCCCACA-AATCATTTTGTTTT   [886]
19Mt.cowani                   CGCTTTTATTTAAGATGGCTGCTTTTAGGCCCACA-AGTCATTTTATTTT   [885]
42Mt.nigricans                CGCTTTTATTTAAGATGGCTGCTTTTAGGCCCACA-AATCATTTTGTTTT   [886]
84Mt.haraldmeieri             CGCTTTTATTTAAGATGGCTGCTTTTAGGCCCACA-AATCATTTTATTTT   [886]
68Mt.bernhardi                CGCTTTTATTTAAGATGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AGTTATTTTTATTT   [885]
01Mt.laevigata                CGCTTTTGTAAATGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACT-AATCATTTTGTTTT   [884]
73Mt.laevigata                CGCTTTTGTAAATGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACT-AATCATTTTGTTTT   [884]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         CGCTTTTATGAAGGATGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AGTCATTTCATTTT   [886]
02Mt.betsileo_Kirindy         CGCTTTTATGAAAGATGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AGTCATTTCATTTT   [884]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    CGCTTTTATGAAAGATGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AGTCATTTCATTTT   [884]
21Mt.betsileo_Anove_a         CGCTTTTATGAAGGATGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AGTCATTTCATTTT   [884]
63Mt.viridis                  CGCTTTTATGAAGGATGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AGTCATTTCATTTT   [884]
05Mt.viridis                  CGCTTTTATGAAGGATGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AGTCATTTCATTTT   [884]
06Mt.expectata                CGCTTTTATGAAGGATGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AATCATTTCATTTA   [884]
69Mt.expectata                CGCTTTTATGAAGGATGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AATCATTTCATTTA   [884]
74Mt.madagascariensis         CGCTTTTGTTTAAGGTGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AATCATTTTATTTT   [883]
13Mt.madagascariensis         CGCTTTTATTTAAGGTGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AATCATTTTATTTT   [884]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    CGCTTTTGTTTAAGGTGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AATCATTTTATTTT   [884]
17Mt.aurantiaca               CGCTTTTGTTTAAGGTGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AATCATTTTATTTT   [883]
61Mt.crocea                   CGCTTTTGTTTAAGGTGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AATCATTTTATTTT   [883]
64Mt.milotympanum             CGCTTTTGTTTAAGGTGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AATCATTTTATTTT   [883]
67Mt.pulchra                  CGCTTTTGTTTAAGGTGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AACCATTTTATTTT   [883]
20Mt.pulchra                  CGCTTTTGTTTAAGGTGGCTGCTTTTAGGCCCACT-AACCATTTTATTTT   [883]
41Md.bicalcaratus             CGCTTTTTTAAAGG-TGGCTGCTTTTAGGCCCACTTAATAATTTTTCTT-   [884]
08Md.grandisonae              CGTTTTT-TAAAAGATGGCTGTTTTTAGGCCCACT---TGATATTTTTCT   [882]
35Boophis_tephraeomystax      CGCTTTT-TTAAAGGTGGCTGCTTTTAGGCCTACT-TG-CTGTATGTATC   [889]

[                                      910       920       930       940       950]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   --ATTGT-GTTACCCTGTAGTATAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [933]
19Mt.cowani                   --ATTGT-ATTACCCTGTAGTATAGGTTGTATCCTATTTCAAATAAGCTG   [932]
42Mt.nigricans                --ATTGT-GTTACCCTGTAGTATAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [933]
84Mt.haraldmeieri             --ATTAT-GTTACCCTGTAGTATAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [933]
68Mt.bernhardi                ---TTAT-ATTACCCTATGATGTAGGTTGTGTCCTGTTTCAAATAAGCTG   [931]
01Mt.laevigata                --GGCGT-ATTACCCTGTGGTGTAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [931]
73Mt.laevigata                --GGCGT-ATTACCCTGTGGTGTAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [931]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         TTGATAT-ATTACCCTGTGGTGTAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [935]
02Mt.betsileo_Kirindy         TTGATAT-ATTACCCTGTGATGTAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [933]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    T-GATAT-ATTACCCTGTGATGTAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [932]
21Mt.betsileo_Anove_a         T-GATAT-ATTACCCTGTGGCGTAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [932]
63Mt.viridis                  TTGATAT-ATTACCCTGTGGTGTAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [933]
05Mt.viridis                  TTGATAT-ATTACCCTGTGGTGTAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [933]
06Mt.expectata                --GATAT-ATTACCCTGTGATGTAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [931]
69Mt.expectata                --GATAT-ATTACCCTGTGATGTAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [931]
74Mt.madagascariensis         T-GATGT-ATTACCCTATGATAAAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [931]
13Mt.madagascariensis         T-GATGT-ATTACCCTATAATAAAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [932]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    T-AATGT-ATTACCCTGTGATAAAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [932]
17Mt.aurantiaca               T-AATGT-ATTACCCTGTGATAAAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [931]
61Mt.crocea                   T-GATGT-ATTACCCTATGATAAAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [931]
64Mt.milotympanum             T-GATGT-ATTACCCTATGATAAAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [931]
67Mt.pulchra                  T-GATGT-ATTACCCTATGATAAAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [931]
20Mt.pulchra                  T-GATGT-ATTACCCTATGATAAAGGTTGTATCCTGTTTCAAATAAGCTG   [931]
41Md.bicalcaratus             --GATAA-ATTACCCAATATAGGAGGTTGTACCCTTTTTCAAATAAGCTG   [931]
08Md.grandisonae              C-GATATTATTACCCTATATTTTAGGTTGTATCCTTTTTCAAATAAGCTG   [931]
35Boophis_tephraeomystax      T-GTAGT-TTTACCCTTTGTACGAGGTTGTATCCTGATTCAAACAAGCTG   [937]

[                                      960       970       980       990       1000]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   TGCCTTATTTGAATAGCTTTTAAGTTTAATGGGGGTTTAGTGTAACTAAG   [983]
19Mt.cowani                   TGCCTTATTTGAATAGCTTTTAAGTTTAATAGAGGTTTAGTGTGACTAAG   [982]
42Mt.nigricans                TGCCTTATTTGAATAGCTTTTAAGTTTAATAGGGGTTTAGTGTAACTAAG   [983]
84Mt.haraldmeieri             TGCCTTATTTGAATAGCTTTTAAGTTTAATAAAGGTTTAGTGTAACTAAG   [983]
68Mt.bernhardi                TGCCTTATTTGAATAACTCTTAAGTTTTATATAATTTTAGTTAATAAAAA   [981]
01Mt.laevigata                TGCCTTATTTGAATAACTCTTAAATTTTATGGGCGTTTGGAAAAACTTGG   [981]
73Mt.laevigata                TGCCTTATTTGAATAACTCTTAAATTTTATGGGCGTTTGGAAAAACTTGG   [981]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAATTTAGTGGCGGTTTAGAGAAACTAGG   [985]
02Mt.betsileo_Kirindy         TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAATTTAGTGAAGGTTTAGATAAACTGAG   [983]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAATTTAGTGAAGGTTTAGAGAAACTGAG   [982]
21Mt.betsileo_Anove_a         TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAATTTAGTGGTGGTTTAGAGAAACTAGG   [982]
63Mt.viridis                  TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAATTTAGTGGCGGTTTAGAGAAACTAGG   [983]
05Mt.viridis                  TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAATTTAGTGGCGGTTTAGAGAAACTAGG   [983]
06Mt.expectata                TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAATTTAGTGAAGGTTTAGATAAACTAAG   [981]
69Mt.expectata                TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAATTTAGTGAAGGTTTAGATAAACTAAG   [981]
74Mt.madagascariensis         TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAGTTTTATTAAGGTTTAGAAGGACTAAA   [981]
13Mt.madagascariensis         TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAGTTTTATTAAGGTTTAGAAGAACTAAA   [982]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAGTTTTGTTAAGGTTTAGAAGTACTAAA   [982]
17Mt.aurantiaca               TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAGTTTTGTTAAGGTTTAGAAGTACTAAA   [981]
61Mt.crocea                   TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAGTTTTGTTAAGGTTTTTAAGGACTAAA   [981]
64Mt.milotympanum             TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAGTTTTGTTAAGGTTTTTAAGGACTAAA   [981]
67Mt.pulchra                  TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAGTTTTATTAAGGTTTAGAAGGACTAAA   [981]
20Mt.pulchra                  TGCCTTATTTGAATAGCTCTTAAGTTTTATTAAGGTTTAGAAGGACTAAA   [981]
41Md.bicalcaratus             TGCCTTATTTGAATGGCTCTTAAGTTTAGTTGGAGTTTACGGAGACTAAA   [981]
08Md.grandisonae              TGCCTTATTTGAATGACTCTTAAACTTAGTGGATGTTTAGAAAAACTAAA   [981]
35Boophis_tephraeomystax      TGCCTTATTTGAATAAATCCTGAGTCTTA-GAAGGTTT--TTTATTTAAT   [984]

[                                      1010      1020      1030      1040      1050]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   AA-AAACTTAAAGTTGAACTAACATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATCT   [1032]
19Mt.cowani                   AA-AAACTTAAAGTTGAACTAACATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATCT   [1031]
42Mt.nigricans                AA-AAACTTAAAGTTGAACTAACATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATCT   [1032]
84Mt.haraldmeieri             AA-AAACTTAAAGTTGAACTAACATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATCT   [1032]
68Mt.bernhardi                GT-AAACTTAAGGTTGAACTTAAATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATCT   [1030]
01Mt.laevigata                AT-AAATTTAAGGTTGAACTAAGATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1030]
73Mt.laevigata                AT-AAATTTAAGGTTGAACTAAGATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1030]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         AA-AAACTTAAGGTTGAACTAAAATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1034]
02Mt.betsileo_Kirindy         GA-AAATTTAAGGTTGAACTAAAATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1032]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    GA-AAATTTAAGGTTGAACTAAAATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1031]
21Mt.betsileo_Anove_a         AA-AAATTTAAGGTTGAACTAAAATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1031]
63Mt.viridis                  AA-AAACTTAAGGTTGAACTAAAATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1032]
05Mt.viridis                  AA-AAACTTAAGGTTGAACTAAAATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1032]
06Mt.expectata                GA-AAATTTAAGGTTGAACTAAAATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1030]
69Mt.expectata                GA-AAATTTAAGGTTGAACTAAAATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1030]
74Mt.madagascariensis         AC-AAACTTAAGGTTGAACTTATATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1030]
13Mt.madagascariensis         AT-AAACTTAAGGTTGAACTTATATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1031]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    AC-AAACTTAAGGTTGAACTTATATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1031]
17Mt.aurantiaca               AC-AAACTTAAGGTTGAACTTATATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1030]
61Mt.crocea                   AT-AAACTTAAGGTTGAACTTATATTCTTTTCTCGAGTAACCAGCTATTT   [1030]
64Mt.milotympanum             AT-AAACTTAAGGTTGAACTTATATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1030]
67Mt.pulchra                  AT-AAACTTAAGGTTGAACTTATATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1030]
20Mt.pulchra                  AT-AAACTTAAGGTTGAACTTATATTCTTTTCTTGAGTAACCAGCTATTT   [1030]
41Md.bicalcaratus             ---AAACTTGAGGTAGAACTAAAATTCTTTTCTTGAGCAACCAGCTATCT   [1028]
08Md.grandisonae              A--AAGTTTAAGGCTGAACTAATATTCTTTTCTTGAGCAACCAGCTATCT   [1029]
35Boophis_tephraeomystax      AGCAGGCTCAGGGTCGAACTTATATTCGTTTCTTAAGTAACCAGCTATCT   [1034]

[                                      1060      1070      1080      1090      1100]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   CTAGGTGCGATAGGTTTGTCGCCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1082]
19Mt.cowani                   CTAGGTGCGATAGGTTTGTCGCCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1081]
42Mt.nigricans                CTAGGTGCGATAGGTTTGTCGCCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1082]
84Mt.haraldmeieri             CTAGGTGCGATAGGTTTGTCGCCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1082]
68Mt.bernhardi                CTAAGTGCGGTAGGTTTGTCGCCTCTACTTGGAAATCGTCCCACTCTATT   [1080]
01Mt.laevigata                CTGAGTGCGGTAGGTTTGTCGCCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1080]
73Mt.laevigata                CTGAGTGCGGTAGGTTTGTCGCCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1080]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         CTGGGTGCGGTAGGTTTATCACCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1084]
02Mt.betsileo_Kirindy         CTGGGTGCGGTAGGTTTATCGCCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1082]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    CTGGGTGCGGTAGGTTTATCGCCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1081]
21Mt.betsileo_Anove_a         CTGGGTGCGGTAGGTTTATCACCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1081]
63Mt.viridis                  CTGGGTGCGGTAGGTTTATCACCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1082]
05Mt.viridis                  CTGGGTGCGGTAGGTTTATCACCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTYTATK   [1082]
06Mt.expectata                CTGAGTGCGGTAGGTTWATCGCCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1080]
69Mt.expectata                CTGAGTGCGGTAGGTTTATCGCCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1080]
74Mt.madagascariensis         CTGAGTGCGGTAGGTTTATCACYTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1080]
13Mt.madagascariensis         CTGAGTGCGGTAGGTTTATCACCTCTACTTGGAAATCTTTCCACTCTATT   [1081]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    CTGAGTGCGGTAGGTTTATCACCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1081]
17Mt.aurantiaca               CTGAGTGCGGTAGGTTTATCACCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1080]
61Mt.crocea                   CTGAGTGCGGTAGGTTTATCACCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1080]
64Mt.milotympanum             CTGAGTGCGGTAGGTTTATCACCTCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1080]
67Mt.pulchra                  CTGAGTGCGGTAGGTTTATCACCGCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1080]
20Mt.pulchra                  CTGAGTGCGGTAGGTTTATCACCGCTACTTGGAAATCTTCCCACTCTATT   [1080]
41Md.bicalcaratus             CTTGGTGCGGTAGGTTTATCGCCACTACTTGGAAATTTTCCCACTCTTTT   [1078]
08Md.grandisonae              CTTGGTGCGGTAGGTTTGTCGCCTCTACTTGGAAATCGTCCCACTCTATT   [1079]
35Boophis_tephraeomystax      CTAAGTTCGGTAGGTTTAT?ACCTCTACTTGAAAATCTTCCCACTCTTTT   [1084]

[                                      1110      1120      1130      1140      1150]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   GCAACAGAGATGGGTTAGCTCTTAAAGTTGTTTCGAAGTAGCTCAC-TTA   [1131]
19Mt.cowani                   GCAACAGAGATGGGTTAGCTCTTAAAGTTGTTTCGAAGTAGCTCAC-TTA   [1130]
42Mt.nigricans                GCAACAGAGATGGGTTAGCTCTTAAAGTTGTTTCGAAGTAGCTCAC-TTA   [1131]
84Mt.haraldmeieri             GCAACAGAGATGGGTTAGCTCTTAAAGTTGTTTCGAAGTAGCTCAC-TTA   [1131]
68Mt.bernhardi                GCAACAGAGATGGGTTGGCTCTTATAGCTGTTTCGAAGTAGCTCAC-TTA   [1129]
01Mt.laevigata                GCAACAGAGATGGGTTGGCTCTTATAGCTGTTTCGAAGTAGCTCACATCA   [1130]
73Mt.laevigata                GCAACAGAGATGGGTTGGCTCTTATAGCTGTTTCGAAGTAGCTCACATCA   [1130]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         GCAACAGAGACGGGTTGGCTCTTACAGCTGTTTCGAAGTAGCTCACGTCA   [1134]
02Mt.betsileo_Kirindy         GCAACAGAGACGGGTTGGCTCTTACAGCTGTTTCGAAGTAGCTCACGTCA   [1132]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    GCAACAGAGACGGGTTGGCTCTTACAGCTGTTTCGAAGTAGCTCACGTCA   [1131]
21Mt.betsileo_Anove_a         GCAACAGAGACGGGTTGGCTCTTACAGCTGTTTCGAAGTAGCTCACGTCA   [1131]
63Mt.viridis                  GCAACAGAGACGGGTTGGCTCTTACAGCTGTTTCGAAGTAGCT???????   [1132]
05Mt.viridis                  GCAACA????????????????????????????????????????????   [1132]
06Mt.expectata                GCAMCAGAGATGGGTTAGCTCTTATAGCTGTTTCGAAGTAGCTTACATCA   [1130]
69Mt.expectata                GCAACAGAGACGGGTTAGCTCTTATAGCTGTTTCGAAGTAGCTCACATCA   [1130]
74Mt.madagascariensis         GCAACAGAGACGGGTTGGCTCTTATGGCTGTTTCGAAGTAGCTCACATCA   [1130]
13Mt.madagascariensis         GCAACAGAGACGGGTTGGCTCTTATAGCTGTTTCGAAGTAGCTCACATCA   [1131]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    GCAACAGAGACGGGTTGGCTCTTATGGCTGTTTCGAAGTAGCTCACATCA   [1131]
17Mt.aurantiaca               GCAACAGAGACGGGTTGGCTCTTATGGCTGTTTCGAAGTAGCTCACATCA   [1130]
61Mt.crocea                   GCAACAGAGACGGGTTAGCTCTTATGGTTGTTTCGAAGTAGCTCACATC?   [1130]
64Mt.milotympanum             GCAACAGAGACGGGTTAGCTCTTATGGCTGTTTCGAAGTAGCTCACATC?   [1130]
67Mt.pulchra                  GCAACAGAGACGGGTTGGCTCTTATGGCTGTTTCGAAGTAGCTCACATCA   [1130]
20Mt.pulchra                  GCAACAGAGACGGGTTGGCTCTTATGGCTGTTTCGAAGTAGCTCACATCA   [1130]
41Md.bicalcaratus             GCAACAGAGATGGGTTGGTTCTTATAACTATTTCGAAGTAGCTCACCT-A   [1127]
08Md.grandisonae              GCAACAGAGATGGGTTTGCTCTTTTAGCTGTTTCGAAGTAGCTCACCT-A   [1128]
35Boophis_tephraeomystax      GCAACAGAGACGGGTTGGCCCA-AGGGCTGTTTTGAAGTAGCTCAC-TTA   [1132]

[                                      1160      1170      1180      1190      1200]
[                                      .         .         .         .         .]

14Mt.baroni                   GTTTCGGGGGGTTAAACTTTAAATTCGTTTTGCTTAATTAGACTGGCTAG   [1181]
19Mt.cowani                   GTTTCGGGGGGTTAAACTTTAAATTCGTTTTGCTTAATTAGACTGGCTAG   [1180]
42Mt.nigricans                GTTTCGGGGGGTTAAACTTTAAATTCGTTTTGCTTAATTAGACTGGCTAG   [1181]
84Mt.haraldmeieri             GTTTCGGGGGGTTAAACTTTAAATTCGTTTTGCTTAATTAGACTGGCTAG   [1181]
68Mt.bernhardi                GTTTCGGGGGGTTAAACTTTAAGTTCGTTTTGCTTAATTAGACTGGCTAG   [1179]
01Mt.laevigata                GTTTCGGGGAGTTAAACTTAAAGTTCGTTTTGCTTAGTTAGACTGGCTAG   [1180]
73Mt.laevigata                GTTTCGGGGAGTTAAACTTAAAGTTCGTTT????????????????????   [1180]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         GTTTCGGGG?????????????????????????????????????????   [1184]
02Mt.betsileo_Kirindy         GTTTCGGGGGGTTAAACTTAAAGTTCATT?????????????????????   [1182]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    GTTTCGGGGGGTTAAACTTAAAGTTC????????????????????????   [1181]
21Mt.betsileo_Anove_a         GTTTCGGGG?????????????????????????????????????????   [1181]
63Mt.viridis                  ??????????????????????????????????????????????????   [1182]
05Mt.viridis                  ??????????????????????????????????????????????????   [1182]
06Mt.expectata                GTTTCGGGGGGTTAAACTTAAAGTTCATT?????????????????????   [1180]
69Mt.expectata                GTTTCGGGGGGTTAAACTTAAAGTTC????????????????????????   [1180]
74Mt.madagascariensis         GTTTCGGGGGGTTAAACTTAAAATTCGTTTTGCTTAGTTAAACTGGCTAG   [1180]
13Mt.madagascariensis         GTTTCGGGGGGTTAAACTTAAAATTCGTTTTGCTTAGTTAAACTAGCTAG   [1181]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    GTTTCGGGGGGTTAAACTTAAAATTCGTTTTGCTTAGTTAAACTAGCTAG   [1181]
17Mt.aurantiaca               GTTTCGGGGGGTTAAACTTAAAATTCGTTTTGCTTAGTTAAACTAGCTAG   [1180]
61Mt.crocea                   ??????????????????????????????????????????????????   [1180]
64Mt.milotympanum             ??????????????????????????????????????????????????   [1180]
67Mt.pulchra                  GTTTCGGGGAGTTAAACTTAAAATTCGTTTTGCTTAATTAAACTAGCTAG   [1180]
20Mt.pulchra                  GTTTCGGGGAGTTAAACTTAAAATTCGTTTTGCTTAATTAAACTAGCTAG   [1180]
41Md.bicalcaratus             GTTTCGGGGGGTTAAACTAAAAATCA-TTTTGCTCAGTCAGACTGACTAG   [1176]
08Md.grandisonae              GTTTCGGGGGGTTAAACTTAAATTTCTTTTTGCTTAGTTTTACTGGCTAG   [1178]
35Boophis_tephraeomystax      GTTTCGGGGGGACAAACT-AAAATTCATTTTGCTTGGGTAAACTAGCTAG   [1181]

[                                      1210      1220]
[                                      .         .  ]

14Mt.baroni                   ACCATGATGC????????????   [1203]
19Mt.cowani                   ACCATGATGC????????????   [1202]
42Mt.nigricans                ACCAT?????????????????   [1203]
84Mt.haraldmeieri             ACCATGATGCCA??????????   [1203]
68Mt.bernhardi                ACCATGATGCCA??????????   [1201]
01Mt.laevigata                ATCATGATGCAAAAGGGTCGAG   [1202]
73Mt.laevigata                ??????????????????????   [1202]
70Mt.betsileo_Nosy_Be         ??????????????????????   [1206]
02Mt.betsileo_Kirindy         ??????????????????????   [1204]
43Mt.cf.betsileo_Morondava    ??????????????????????   [1203]
21Mt.betsileo_Anove_a         ??????????????????????   [1203]
63Mt.viridis                  ??????????????????????   [1204]
05Mt.viridis                  ??????????????????????   [1204]
06Mt.expectata                ??????????????????????   [1202]
69Mt.expectata                ??????????????????????   [1202]
74Mt.madagascariensis         ACCATGATGC????????????   [1202]
13Mt.madagascariensis         ACCATGATGC????????????   [1203]
62Mt.aurantiaca_aurantiaca    ACCATGATGC????????????   [1203]
17Mt.aurantiaca               ACCATGATGC????????????   [1202]
61Mt.crocea                   ??????????????????????   [1202]
64Mt.milotympanum             ??????????????????????   [1202]
67Mt.pulchra                  ACCATGATGCCAA?????????   [1202]
20Mt.pulchra                  ACCATGATGC????????????   [1202]
41Md.bicalcaratus             ACCATGATGCAAAAGGGTCGAG   [1198]
08Md.grandisonae              ACCATGATGCAAAAGGGTCGAG   [1200]
35Boophis_tephraeomystax      ACCATGATGC????????????   [1203]
;
END;


BEGIN CODONS;
GENCODE UNIVNUC
;
END;

BEGIN ASSUMPTIONS;
	OPTIONS  DEFTYPE=unord PolyTcount=MINSTEPS ;

END; 

BEGIN PAUP;
Lset  Base=(0.2797 0.1671 0.1907)  Nst=6  Rmat=(1.0000 8.9868 1.0000 1.0000 4.6760)  Rates=gamma  Shape=0.3676  Pinvar=0.3709;
END;