Die Bibliothek ist eine kleine wissenschaftliche Spezialbibliothek mit den Sammelschwerpunkten Meeresgeologie und Meeresbiologie. Sie ist eine Präsenzbibliothek und nimmt nicht am Fernleihverkehr teil. Die Hauptaufgabe der Institutsbibliothek besteht darin, die wissenschaftlichen Mitarbeiter*innen des Hauses mit Literatur zu versorgen.
Unsere Bibliothek ist der Wilhelmshavener Fachinformationseinrichtungen und wissenschaftliche Bibliotheken (WIFI) und Arbeitsgemeinschaft meereskundlicher Bibliotheken (AmB) sowie der AG Bibliotheken und Schriftentausch im Senckenbergverbund angeschlossen.
Der Bestand der Abteilung Meeresforschung umfasst ca. 3.100 Buchtitel, 420 Karten, 330 Zeitschriften und Serien sowie ca. 21500 Separatdrucke. Der Bestand des DZMB umfasst ca. 400 Bücher/Monographien und ca. 2.800 Separatdrucke. Die Monoculus-Bibliothek ist mit ca. 23.000 Titeln eine der größten Literatursammlungen der Welt zum Thema Copepoden (Ruderfußkrebse). Archivgut aus Nachlässen wird in den Bibliotheksbestand eingearbeitet.
Die Bibliothek verfügt über einen permanenten Zugang zu den Zeitschriften der Senckenbergbestände und der DFG Nationallizenzen. Fernleihen werden getätigt über den „Gemeinsamen Bibliotheksverbund (GBV) – GVK: gemeinsamer Verbundskatalog“. Die elektronische Erfassung der Bibliotheksbestände erfolgt mit JabRef: ein Open Source Bibliographie Reference Manager. Es ist eine vereinfachte Verwaltung und Organisation. Die Nutzung des Präsenzbestandes für externe Nutzer ist nach telefonischer Anmeldung möglich. Führungen durch die Bibliothek sind nur nach Absprache möglich.
