pm tierbewegung 23.01.2018

Genomische Vielfalt, Evolution und Klima


Wir arbeiten daran, die biologische Vielfalt im Erdsystem auf genomischer Ebene zu verstehen, indem wir die Auswirkungen des Klimas und anderer Faktoren auf die räumliche und zeitliche Verteilung der genomischen Vielfalt von Individuen, Populationen und ökologischen Gemeinschaften untersuchen.

Insbesondere konzentrieren wir uns auf das Verständnis der genomischen Grundlagen der Anpassung an den Klimawandel, den Einfluss des Klimas auf die Genomarchitektur und -variation sowie die genetischen Reaktionen ökologischer Gemeinschaften auf den Klimawandel – und dies auch in Wechselwirkung mit anderen anthropogenen Faktoren. Wir erforschen die heutige genomische Vielfalt, um Rückschlüsse auf vergangene Evolutionsprozesse zu ziehen, und wollen mit Hilfe integrativer Modelle die Evolutionsfähigkeit von Populationen und Arten in der Zukunft einschätzen.

Schlüsselfragen

Was ist die genomische Grundlage für Anpassungen an den Klimawandel und andere anthropogene Einflussfaktoren?
Wie beeinflussen das Klima und andere Einflussfaktoren die Genomarchitektur und die Genomvariation?
Was ist die genomische Reaktion ökologischer Gemeinschaften auf den Klimawandel in Wechselwirkung mit anderen Einflussfaktoren?

Sprecher*innen

Prof. Dr. Imke Schmitt
Professor, Deputy Director 'Senckenberg Biodiversity and Climate Research Centre', Head of Research Group 'Molecular Evolutionary Biology'

RESEARCH INTERESTS

My primary research interest is the evolution of symbiotic organisms, in particular those that form partnerships with fungi. I have been using phylogenetics and comparative phylogenetics to analyze the evolutionary history of lichen-forming fungi and their characters. Since many fungal groups produce a wide variety of secondary metabolites, I am also interested in exploring the potential of phylogenetic methods in natural product chemistry to understand the evolution of chemical characters and biosynthetic genes. Currently my lab is studying the effects of climate change on the assembly of fungal communities associated with plant leaves and roots using next generation sequencing approaches. We want to find out, if the composition of symbiotic fungal communities affects local adaptation of the plants. My work integrates a variety of disciplines, such as molecular phylogenetics, systematics, natural product chemistry, and metagenomics.

LINKS

Ecological functions of bioactive natural products from lichens (Project at LOEWE Centre for Translational Biodiversity Genomics)

For a list of all my publications, see my Google Scholar profile

Mitarbeiterfoto
Prof. Dr. Markus Pfenninger
Professor, Head of the Molecular Laboratory, Head of Research Group 'Molecular Ecology'

Research interests

The focus of my research is the genomic basis of niche evolution, speciation and local adaptation with closely related species pairs and intraspecific variation in land and freshwater snails, non-biting midges and extremophile molly fishes. We take an integrative approach: field studies, ecological and evolutionary experiments, comparative genomic approaches and experimental evolution. The ultimate vision thereby is to relate ecological differences functionally to their genomic basis.

Former Projects:

D1: cross-taxon genomic basis of climate-relevant fitness traits

D3: development of taxonomic dna-chips and other high-troughput tests for the routine identification of monitoring samples

D3.1: benthos barcoding

A1.3: radiation of pulmonata during the cenozoic [ellobioidea] (2008-2011)

A1.7: model selection

B1.14: tropical marine ecosystems: diversity and dynamics of coral reef ecosystems and reef-associated fish assemblages

C5.2: evolutionary adaptation potential of key aquatic species of different climatic regions

Curriculum Vitae

Aktuelle Publikationen